Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VGLL3A8MV65 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VGLL3A8MV65 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms