Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GMNCA6NCL1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GMNCA6NCL1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms