Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PSDA5PKW4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms