Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MTMR11A4FU01 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms