Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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