Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNPO3Q9Y5L0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms