Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM2AQ9Y2K7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM2AQ9Y2K7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms