Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNRF3Q9ULT6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms