Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms