Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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VAPAQ9P0L0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAPAQ9P0L0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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