Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GDE1Q9NZC3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GDE1Q9NZC3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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