Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MIS18AQ9NYP9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms