Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
DDIT4Q9NX09 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DDIT4Q9NX09 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms