Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COMMD8Q9NX08 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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