Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM55Q9BYV6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM55Q9BYV6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms