Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCDC106Q9BWC9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms