Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PAGR1Q9BTK6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PAGR1Q9BTK6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms