Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
AGMATQ9BSE5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms