Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HERPUD2Q9BSE4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HERPUD2Q9BSE4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms