Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EBF4Q9BQW3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms