Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SPOCK3Q9BQ16 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SPOCK3Q9BQ16 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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SPOCK3Q9BQ16 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SPOCK3Q9BQ16 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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