Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS2Q99743 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPAS2Q99743 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms