Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHOX2BQ99453 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms