Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MVB12AQ96EY5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms