Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC10A4Q96EP9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC10A4Q96EP9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms