Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF34Q969K3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms