Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ANKRD42Q8N9B4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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