Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
LINC00612Q8N6U2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms