Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4T4

ARHGEF39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF39Q8N4T4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ARHGEF39Q8N4T4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms