Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCDC71Q8IV32 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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