Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOP1Q7RTM1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms