Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC149Q6ZUS6 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms