Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPOCD1Q6ZMY3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms