Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRT80Q6KB66 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT80Q6KB66 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms