Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITRM1Q5JRX3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms