Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKDCCQ504Y2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms