Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC38Q502W7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms