Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUSP28Q4G0W2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP28Q4G0W2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms