Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TWISTNBQ3B726 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms