Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SGSM1Q2NKQ1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGSM1Q2NKQ1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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