Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PTPRNQ16849 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRNQ16849 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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