Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPROQ16827 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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