Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CA9Q16790 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CA9Q16790 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CA9Q16790 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CA9Q16790 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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