Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIF1AQ16665 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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HIF1AQ16665 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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HIF1AQ16665 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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HIF1AQ16665 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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HIF1AQ16665 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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HIF1AQ16665 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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HIF1AQ16665 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIF1AQ16665 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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