Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SGCBQ16585 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SGCBQ16585 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SGCBQ16585 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SGCBQ16585 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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