Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USF2Q15853 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USF2Q15853 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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