Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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