Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
EFNB3Q15768 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms