Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYTH1Q15438 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms