Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PUM3Q15397 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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